sábado, março 02, 2013

"Bactérias" do outro mundo


(Carl Woese, 1928-2012. Foto: Don Hame)

Na parte final da Guerra dos Mundos de H.G. Wells, o narrador, referindo-se aos invasores marcianos que sucumbiram apenas às bactérias do nosso planeta, afirma (tradução minha) "Mas não há bactérias em Marte e, assim que estes invasores [marcianos] chegaram, eles beberam e comeram, os nossos aliados microscópicos começaram a derrotá-los.". Isto corresponde ao nosso imaginário sobre as bactérias: organismos "invisíveis" e perigosos.
Mas há outra característica que muitas partilham: a resistência a condições extremas. No entanto muitas das resistentes, as arquebactérias, não são verdadeiras bactérias. Podem ser consideradas bactérias no sentido celular, ou seja, são procarióticas (células simples sem núcleo) ao contrário das nossas, eucarióticas (com núcleo, contendo os cromossomas). É ao nível molecular que se encontram as diferenças mais marcantes que as colocam tão distantes filogeneticamente das bactérias verdadeiras (eubactérias) como os organismos eucarióticos (animais e plantas, por exemplo).
Esta distinção deve-se ao trabalho pioneiro de Carl Woese, infelizmente falecido recentemente no final de 2012. Woese aplicou as técnicas de sequenciação de DNA para determinar a sequência do RNA ribossomal, existente em todos os seres vivos, e compará-la entre espécies bacterianas. Com esta abordagem o que Woese fez foi reescrever toda a história evolutiva dos procariotas porque os dois sistemas de classificação (clássico, baseado em características morfológicas e bioquímicas, e o molecular, de Woese) coincidiam em muitos casos excepto num grupo de "bactérias", as arquebactérias, cujas sequências eram tão diferentes como as nossas são das verdadeiras bactérias. Eis o contributo revolucionário de Woese, a composição de uma molécula, o RNA ribossomal, foi usada como uma medida da evolução biológica, possibilitando o seu uso na classificação dos seres vivos.
Apesar dos dados moleculares, apoiando a separação das arquebactérias das eubactérias, serem tão fortes há características mais "clássicas" que as separam. As arquebactérias são organismos "do outro mundo" porque habitam fontes hidrotermais, em alguns casos com temperaturas acima dos 100ºC ou com acidez perto do limite da escala de pH e ambientes com concentrações saturantes de sal. Algumas até são 6000 vezes mais resistentes a radiações do que seres humanos. Bom, se não há mesmo bactérias em Marte, como disse Wells, não é pela falta de adaptação às condições do planeta vermelho.

Publicado no Correio do Minho (28/2/13) e acessível na página da Escola de Ciências da UMinho.

domingo, novembro 25, 2012

Mechanism of DNA Replication (Advanced)

e ainda falta a topoisomerase, DNA ligase....

domingo, novembro 18, 2012

DNA Helicase

Em actividade desenrola o DNA mas provoca tensão torcional à frente. Aí entram em acção as topoisomerases...


segunda-feira, outubro 22, 2012

A última viagem do Endeavour

Depois de andar à potência máxima para escapar à gravidade do planeta, na última viagem a subtileza de movimentos cuidados para não tocar em casas e árvores!




quinta-feira, outubro 11, 2012

E. coli miniprep

Este vídeo serve de guia para a aula prática. Atenção às manipulações e alterações na amostra. Infelizmente as soluções que vamos usar são menos glamorosas; não têm aquelas cores bonitas deste vídeo.

O Nobel da Química para os receptores celulares de membrana

Um pequeno comentário no Ciência Hoje sobre o prémio a Kobilka e Lefkowitz.

quarta-feira, outubro 10, 2012

From Green to Brown

O clássico do Outono. As mudanças moleculares nas folhas das árvores são visíveis do espaço.
From Green to Brown

domingo, outubro 07, 2012

Isolamento de DNA plasmídico com um kit

Método de lisa alcalina com ligação por afinidade do pDNA à resina de sílica. Depois é só eluir com água ou tampão.

sexta-feira, setembro 28, 2012

Endonucleases de restrição

Animação

Animação mais realista

Experiência de Hershey e Chase: os gloriosos anos da procura da base química da informação genética

Após mais de um ano de ausência o regresso aos posts com uma saudação especial aos meus novos alunos do 2º ano de Biologia Aplicada.

segunda-feira, junho 13, 2011

The eyes of Cassini at Saturn

This video shows the views of Cassini when visiting Saturn. The style looks like old science fiction movies with a mysterious ambiance reinforced by the background music.

terça-feira, maio 24, 2011

Aperiodic crystal


This is a characteristic that Schrodinger predicted for DNA as the support of genetic information, published in the seminal book "What is life?". This book was based on Schrodinger's lectures at the Trinity College in Dublin in 1943, before the discover of the molecular structure of DNA!
There is a Portuguese translation: Schrödinger, Erwin. O que é a vida? Espírito e matéria. trad. M. L. Pinheiro. Lisboa: Fragmentos, 1989.

segunda-feira, maio 23, 2011

High throughput approach on chromatin dynamics

Check this link for a paper on FAIRE, an approach that reveals the open chromatin (non-condensed with histones), which is available for interaction with proteins that control gene expression.

segunda-feira, abril 11, 2011

Northern Blot

The complete process of this very long protocol to remember in our practical and theoretical-practical classes.